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Projeto pretende ​​​​​​​sequenciar o DNA de toda a vida na Terra

24/04/2018 ( Caderno: Meio Ambiente )

Consrcio com participao da FAPESP quer
sequenciar o DNA de toda a vida na Terra

Projeto pretende sequenciar o genoma de 1,5 milho
de espcies de plantas, animais, fungos e outros
organismos eucariontes

Estima-se que existam na Terra entre 10 milhes e 15 milhes de espcies eucariticas, como plantas, animais, fungos e outros organismos cujas clulas tm um ncleo que abriga seu DNA cromossmico. Mas apenas 14% deles (2,3 milhes) so conhecidos e menos de 0,1% (15 mil) tiveram seu DNA sequenciado completamente.

O conhecimento dessa pequena frao da biodiversidade terrestre resultou em enormes avanos na agricultura, medicina e indstrias baseadas em biotecnologia, alm de melhorias nas estratgias para conservao de espcies ameaadas de extino, avaliam pesquisadores da rea.

A fim de preencher a enorme lacuna no conhecimento e explorar o potencial cientfico, econmico, social e ambiental da biodiversidade eucaritica terrestre, um consrcio internacional pretende sequenciar, catalogar e caracterizar o genoma de todas as espcies eucariticas da Terra ao longo de 10 anos.

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Os objetivos e os desafios da iniciativa, denominada Projeto BioGenoma da Terra (EBP, na sigla em ingls), foram descritos em um artigo publicado nesta segunda-feira (23/04) na revistaProceedings of the National Academy of Sciences(PNAS), da Academia Norte-Americana de Cincias.

O projeto ter participao da FAPESP no mbito dos programas de Pesquisas em Caracterizao, Conservao, Restaurao e Uso Sustentvel da Biodiversidade (BIOTA) e de Pesquisa emeScience e Data Science.

A participao da FAPESP no Projeto BioGenoma da Terra abre para pesquisadores no Estado de So Paulo a possibilidade de participarem em um dos projetos de pesquisa mais ousados da atualidade. Alm disso, sendo o Brasil um dos pases mais biodiversos, os objetivos podem contribuir de forma muito destacada para o pas, disse Carlos Henrique de Brito Cruz, diretor cientfico da FAPESP.

O projeto considerado um dos mais ambiciosos da histria da biologia e, na avaliao de seus coordenadores, s ser possvel realiz-lo agora em razo dos avanos na tecnologia de sequenciamento genmico, computao de alto desempenho, armazenamento de dados e bioinformtica e da queda de custo do sequenciamento de genoma. E, alm disso, da valorizao dos biobancos locais que armazenam a biodiversidade de forma catalogada, como museus, herbrios e centros de coleo de culturas.

Com o custo atual de US$ 1 mil para sequenciar o genoma de um vertebrado de tamanho mdio caindo, ser possvel sequenciar, ao custo aproximado de US$ 4,7 bilhes, o genoma de todo o 1,5 milho de espcies conhecidas de eucariotos. E tambm de entre 10 e 15 milhes de espcies desconhecidas a maioria deles organismos unicelulares, insetos e pequenos animais nos oceanos , estimam os coordenadores do projeto.

O custo, que inclui gastos com instrumentos de sequenciamento, coletas de amostras, armazenamento, anlise, visualizao e disseminao de dados e gerenciamento de projetos, comparvel ao investido no Projeto Genoma Humano, iniciado em 1990 e concludo em 2003, que custou US$ 4,8 bilhes.

Os investimentos no Projeto Genoma Humano tiveram enormes impactos no apenas na medicina humana, mas tambm na medicina veterinria, biocincia agrcola, biotecnologia, cincia ambiental, energia renovvel, cincia forense e na biotecnologia industrial. Um relatrio de 2013 do Battelle Memorial Institute estimou o benefcio financeiro do projeto para a economia dos Estados Unidos em cerca de US$ 1 trilho.

Aps a concluso do Projeto Genoma Humano, muitos organismos de importncia biomdica, agrcola e industrial tiveram seus genomas sequenciados. E, em 2015, um grupo de pesquisadores das universidades da Califrnia em Davis e de Illinois e do Instituto Smithsonian, nos Estados Unidos, organizou uma reunio com representantes de universidades, instituies de pesquisa e agncias de fomento de diferentes pases que deu origem ao Projeto BioGenoma da Terra em que decidiram que um projeto ainda mais ambicioso era necessrio: sequenciar o DNA de toda a vida complexa na Terra.

O professor de evoluo e ecologia na Universidade da Califrnia em Davis e presidente do grupo de trabalho que originou o projeto, Harris Lewin, estima que os impactos econmicos do projeto BioGenoma da Terra podero ser semelhantes ou at mesmo superar os do Projeto Genoma Humano. Com a diferena de que sero distribudos globalmente e, principalmente, para pases em desenvolvimento, como o Brasil, que detm grande parte da biodiversidade mundial, ponderou.

O Projeto BioGenoma da Terra lanar as bases cientficas para uma nova bioeconomia que tem o potencial de trazer solues inovadoras para problemas de sade, ambientais, econmicos e sociais para pessoas em todo o mundo, especialmente em pases subdesenvolvidos que possuem ativos de biodiversidade significativos, disse Lewin em comunicado imprensa.

Em agosto de 2017, com o objetivo de envolver a comunidade cientfica brasileira no projeto, a FAPESP e a Academia Brasileira de Cincias (ABC) organizaram oWorkshop Biodiversity and Biobank. Realizado no auditrio da FAPESP, o evento contou com a presena de Lewin e de pesquisadores do Brasil e dos Estados Unidos.

Participaram do workshop curadores de diversas colees biolgicas brasileiras, que se reuniram com representantes do EBP e da Global Genome Biodiversity Network para discutir necessidades e entraves para a participao brasileira nessas iniciativas.

Potenciais impactos

Na avaliao dos coordenadores do EBP, os resultados do sequenciamento do genoma de todas as espcies eucariticas existentes na Terra possibilitaro o desenvolvimento de melhores ferramentas de conservao de espcies e ecossistemas ameaados particularmente aqueles afetados pelas mudanas climticas e de preservao e melhoria de servios ecossistmicos.

O ndice Planeta Vivo que mede as tendncias da diversidade biolgica da Terra indica que entre 1970 e 2017 ocorreu um declnio de 58% das populaes de vertebrados do planeta, e a Unio Internacional para Conservao da Natureza (IUCN) estima que entre 23 mil e 80 mil espcies pesquisadas hoje esto se aproximando da extino.

Estima-se que at 50% das espcies podem se extinguir at 2050, principalmente devido ao uso intensivo de recursos naturais, destacam os autores do artigo.

O Projeto BioGenoma da Terra nos dar uma viso sobre a histria e a diversidade da vida e nos ajudar a entender melhor como conserv-la, disse Gene Robinson, diretor do Instituto de Biologia Genmica da Universidade de Illinois e copresidente do grupo de trabalho que deu origem ao projeto.

O grupo de trabalho tambm avalia que o projeto ser essencial para o desenvolvimento de novos medicamentos para doenas infecciosas e hereditrias, bem como para a criao de novos combustveis biolgicos sintticos e fontes de alimentos para a populao humana, que deve atingir 9,6 bilhes de pessoas at 2050.

Estamos no meio do sexto grande evento de extino da vida em nosso planeta, que no s ameaa as espcies selvagens, mas tambm representa um perigo para a oferta global de alimentos, ressaltam os autores do artigo naPNAS.

A fim de atingir os objetivos de sequenciar o genoma da biodiversidade eucaritica da Terra e disponibilizar as informaes em um repositrio digital aberto, o projeto est estabelecendo uma srie de parcerias com grupos de cientistas que trabalham com diferentes grupos de organismos. Entre eles, oGlobal Genome Biodiversity Network, oVertebrate Genomes Project, oPlant Genome Projectse o 5000 Insect Genomes Project.

Alguns dos principais desafios do projeto sero coordenar essas iniciativas de sequenciamento genmico em andamento, desenvolver uma estratgia global para coleta e preservao adequada de exemplares para permitir a produo de conjuntos de genomas de alta qualidade e criar ferramentas de computao que possibilitem interpretar as sequncias genmicas armazenadas. E, sobretudo, disponibiliz-las de modo organizado para a comunidade cientfica e para a sociedade.

O sequenciamento do genoma dos organismos talvez represente a etapa mais fcil do projeto. Os maiores desafios sero ter amostras de material com a qualidade necessria e ferramentas que possibilitem interpretar a enorme quantidade de dados que sero gerados, disse Marie-Anne Van Sluys, professora do Instituto de Biocincias da Universidade de So Paulo (IB-USP), que integra o grupo de trabalho que coordena do projeto.

Os pesquisadores estimam que o sequenciamento do genoma dos organismos dever exigir cerca de 1 exabyte (1 bilho de gigabytes) de capacidade de armazenamento digital e gerar desafios e oportunidades para o desenvolvimento de algoritmos computacionais que possibilitem visualizar, comparar e entender a conexo das sequncias do genoma com a evoluo dos organismos e com os ecossistemas. Alm disso, poder dar origem a novas tecnologias para coleta de amostras utilizando drones e veculos terrestres e aquticos autnomos equipados com cmeras de alta resoluo.

O projeto representa uma oportunidade para ns, pesquisadores no Brasil, de criar e inovar no s em sequenciamento de genoma, mas tambm em anlise e visualizao de dados, coleta, preservao de amostras e diversos outros fatores, avaliou Sluys.


Fonte: Agncia Fapesp / Fotos Reproduo Andreas Weith / Wikimedia


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